Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR47

SPTY2D1-AS1, SPTY2D1 antisense RNA 1, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms