Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR11

CENPVL1, Centromere protein V-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1A0A0U1RR11 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPVL1A0A0U1RR11 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPVL1A0A0U1RR11 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms