Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms