Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms