Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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