Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms