Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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