Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLEQ07864 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLEQ07864 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms