Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms