Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNU13P55769 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms