Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP5P45974 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP5P45974 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP5P45974 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP5P45974 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP5P45974 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP5P45974 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP5P45974 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP5P45974 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP5P45974 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP5P45974 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP5P45974 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms