Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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GCSHP23434 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCSHP23434 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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GCSHP23434 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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GCSHP23434 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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