Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms