Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms