Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
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