Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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FOXQ1Q9C009 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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FOXQ1Q9C009 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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FOXQ1Q9C009 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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FOXQ1Q9C009 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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FOXQ1Q9C009 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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FOXQ1Q9C009 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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FOXQ1Q9C009 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXQ1Q9C009 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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