Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q1T7F1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q1T7F1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q1T7F1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q1T7F1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q1T7F1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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