Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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