Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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