Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD1P98174 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms