Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BLMP54132 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BLMP54132 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BLMP54132 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BLMP54132 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BLMP54132 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BLMP54132 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BLMP54132 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BLMP54132 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BLMP54132 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BLMP54132 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms