Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms