Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms