Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSEQ9UL01 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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