Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms