Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS25

SPANXB1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXB1Q9NS25 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPANXB1Q9NS25 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms