Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMUB1Q9BVT8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms