Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU65

UBN2, Ubinuclein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN2Q6ZU65 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UBN2Q6ZU65 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms