Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00575Q6W349 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms