Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN2Q63HK3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms