Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms