Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRHQ9HD43 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms