Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMKK2Q96RR4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms