Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2E2Q96LR5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2E2Q96LR5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2E2Q96LR5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2E2Q96LR5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2E2Q96LR5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2E2Q96LR5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2E2Q96LR5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2E2Q96LR5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2E2Q96LR5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2E2Q96LR5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBE2E2Q96LR5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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