Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD13Q8WZ19 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms