Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ4

LRP11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11Q86VZ4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms