Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms