Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DDX50-204ENST00000471475 888 ntTSL 57.83□□□□□ -1.167e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 BRD8-214ENST00000454473 3005 ntTSL 57.53□□□□□ -1.28e-13■■■□□ 16
PABPC4Q13310 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.217e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 BRD8-211ENST00000441656 2899 ntTSL 57.37□□□□□ -1.238e-13■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZCCHC7-206ENST00000488607 884 ntTSL 27.11□□□□□ -1.277e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PRC1-210ENST00000556972 728 ntTSL 57.09□□□□□ -1.275e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.287e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 HAUS4-219ENST00000556421 851 ntTSL 26.99□□□□□ -1.297e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC1-204ENST00000571947 306 ntTSL 36.83□□□□□ -1.325e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 BRD8-205ENST00000418329 2912 ntTSL 56.83□□□□□ -1.328e-13■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZCCHC7-207ENST00000496099 721 ntTSL 36.73□□□□□ -1.337e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 WDR12-204ENST00000467777 482 ntTSL 26.73□□□□□ -1.335e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.335e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.365e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TM2D1-206ENST00000472357 744 ntTSL 26.31□□□□□ -1.47e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 CLINT1-208ENST00000524306 2905 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.467e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.55e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 CLINT1-202ENST00000518855 3394 ntTSL 25.44□□□□□ -1.547e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.621e-11■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.621e-11■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RNF217-207ENST00000519565 10660 ntTSL 54.93□□□□□ -1.627e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.637e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.777e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 BTK-205ENST00000470069 424 ntTSL 22.86□□□□□ -1.957e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 CHURC1-201ENST00000547625 326 ntTSL 3-1.26□□□□□ -2.617e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 VTI1B-203ENST00000554636 565 ntTSL 34.95□□□□□ -1.621e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.74e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.434e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.284e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.643e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.394e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.24e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 LAP3-202ENST00000503467 1709 ntTSL 29.85□□□□□ -0.834e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL29-208ENST00000492277 537 ntTSL 319.86■□□□□ 0.772e-27■■■□□ 16
PABPC4Q13310 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 C19orf53-204ENST00000588858 666 ntTSL 39.48□□□□□ -0.892e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 C19orf53-201ENST00000221576 504 ntTSL 27.59□□□□□ -1.192e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL27A-203ENST00000525981 297 ntTSL 517.85■□□□□ 0.451e-33■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.927e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.227e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.267e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SRP68-203ENST00000542536 1714 ntTSL 213.04□□□□□ -0.327e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SRP68-207ENST00000588643 2040 ntTSL 211.79□□□□□ -0.527e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.922e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.872e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.182e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 VDAC2-207ENST00000460044 770 ntTSL 212.24□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL10-217ENST00000492572 1656 ntTSL 519.59■□□□□ 0.732e-15■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-15■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL10-210ENST00000458500 585 ntTSL 1 (best)15.99■□□□□ 0.152e-15■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL10-215ENST00000489200 1519 ntTSL 215.23■□□□□ 0.032e-15■■■□□ 16
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PABPC4Q13310 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.162e-15■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL10-207ENST00000436473 657 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-15■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-15■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL10-216ENST00000491035 1369 ntTSL 512.69□□□□□ -0.382e-15■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.532e-15■■■□□ 16
PABPC4Q13310 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.336e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.266e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.066e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.016e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.936e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 FAM3A-212ENST00000434658 1817 ntTSL 520.64■□□□□ 0.896e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 FAM3A-222ENST00000621967 1901 ntTSL 219.34■□□□□ 0.696e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.181e-9■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.24e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.144e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.924e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.374e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PFDN5-219ENST00000553171 484 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.546e-11■■■□□ 16
PABPC4Q13310 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.292e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPS19BP1-203ENST00000459956 852 ntTSL 224.57■■□□□ 1.527e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-223ENST00000498481 1119 ntTSL 227.59■■■□□ 2.013e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-210ENST00000461234 1069 ntTSL 227.59■■■□□ 2.013e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-213ENST00000464824 525 ntTSL 225.61■■□□□ 1.693e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-218ENST00000474709 731 ntTSL 525.61■■□□□ 1.693e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-226ENST00000527418 4508 ntTSL 222.9■■□□□ 1.263e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.793e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.333e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-216ENST00000472434 2894 ntTSL 516.59■□□□□ 0.253e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.183e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-225ENST00000526491 3091 ntTSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.093e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.093e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.083e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-227ENST00000529473 3016 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.073e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.662e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.612e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.52e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-209ENST00000565205 1084 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-207ENST00000564404 915 ntTSL 314.64□□□□□ -0.072e-7■■■□□ 16
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