Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 GABRE-202ENST00000417300 619 ntTSL 211.14□□□□□ -0.639e-36■■□□□ 13.7
TARDBPQ13148 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 29.5□□□□□ -0.899e-36■■□□□ 13.7
TARDBPQ13148 PKM-217ENST00000566809 560 ntTSL 419.49■□□□□ 0.718e-9■■□□□ 13.7
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TARDBPQ13148 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.655e-7■■□□□ 13.7
TARDBPQ13148 FNDC3B-206ENST00000443501 678 ntTSL 38.63□□□□□ -1.033e-6■■□□□ 13.6
TARDBPQ13148 MED13L-207ENST00000551197 489 ntTSL 55.23□□□□□ -1.579e-9■■□□□ 13.6
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TARDBPQ13148 PICALM-214ENST00000530692 963 ntTSL 55.23□□□□□ -1.572e-6■■□□□ 13.6
TARDBPQ13148 PICALM-211ENST00000529016 757 ntTSL 35.05□□□□□ -1.62e-6■■□□□ 13.6
TARDBPQ13148 PICALM-207ENST00000526961 802 ntTSL 55□□□□□ -1.612e-6■■□□□ 13.6
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TARDBPQ13148 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.462e-6■■□□□ 13.6
TARDBPQ13148 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■■□□□ 13.6
TARDBPQ13148 IQSEC1-203ENST00000474467 436 ntTSL 38.12□□□□□ -1.112e-6■■□□□ 13.6
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TARDBPQ13148 HDAC6-204ENST00000376643 907 ntTSL 515.04■□□□□ -02e-7■■□□□ 13.5
TARDBPQ13148 HDAC6-206ENST00000426196 882 ntTSL 314.96□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 13.5
TARDBPQ13148 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-7■■□□□ 13.5
TARDBPQ13148 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-7■■□□□ 13.5
TARDBPQ13148 HDAC6-217ENST00000469223 796 ntTSL 513.55□□□□□ -0.242e-7■■□□□ 13.5
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TARDBPQ13148 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-7■■□□□ 13.5
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TARDBPQ13148 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.053e-8■■□□□ 13.4
TARDBPQ13148 RB1CC1-205ENST00000518468 507 ntTSL 34.3□□□□□ -1.723e-8■■□□□ 13.4
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TARDBPQ13148 CEP95-202ENST00000553956 2669 ntTSL 1 (best)4.38□□□□□ -1.711e-10■■□□□ 13.4
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TARDBPQ13148 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-8■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.142e-8■■□□□ 13.3
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TARDBPQ13148 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.454e-7■■□□□ 13.3
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TARDBPQ13148 MAP4K3-204ENST00000429397 689 ntTSL 324.08■■□□□ 1.456e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.41e-12■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.36e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.196e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.186e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.016e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.486e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.526e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 EIPR1-213ENST00000482570 582 ntTSL 211.16□□□□□ -0.626e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.76e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 ABCC5-206ENST00000437205 5852 ntTSL 510.54□□□□□ -0.726e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 ABCC5-202ENST00000334444 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.756e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 KIF3B-201ENST00000375712 6103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.826e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 UPF2-202ENST00000357604 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.016e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 ERI1-202ENST00000518663 698 ntTSL 57.81□□□□□ -1.166e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.286e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.396e-7■■□□□ 13.3
TARDBPQ13148 SMYD3-211ENST00000482592 514 ntTSL 36.06□□□□□ -1.446e-7■■□□□ 13.3
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TARDBPQ13148 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.15e-7■■□□□ 13.2
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