Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD4O95243 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD4O95243 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD4O95243 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD4O95243 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms