Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms