Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms