Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNRF3Q9ULT6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms