Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms