Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms