Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms