Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD1Q8N9F7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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