Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms