Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6P435 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6P435 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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