Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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